Philipp und ich machen zur Zeit bei den Münsteraner Bioinformatikern ein kleines Sommerprojekt und im Zuge dessen wir beide auch gerade Python zu lernen. Was gar nicht so einfach ist, bislang haben wir uns hauptsächlich mit try & error über Wasser gehalten und uns dafür auch gar nicht so schlecht geschlagen, denn unsere Vorkenntnisse bestanden nur daraus in der Schule mal Pascal angeschnitten zu haben.
Doch auf Dauer bringt das wenig und um auch etwas schneller zum Ziel zu kommen haben wir nun neben dem Buch Learning Python auch noch eine andere nette Quelle aufgetan:
Das Pasteur-Institut hat extra für Biologen zwei Tutorials geschrieben. Zum einen gäbe es da die allgemeine Einführung für alle die noch gar keine Ahnung vom Programmieren haben. Und zum anderen den „Python course in bio informatics„.
Besonders nett für Biologen: Alle Beispiele kommen aus dem Umfeld und auch der Gebrauch der spezifischen Bio-Pythonbibliothek wird gut erklärt. Für alle Interessierten sicherlich eine gute Lektüre.
Hi
) zwar langsamer aber doch recht schön zum lernen
In welchem Gebiet willst du Python einsetzen? Zur Simulation oder für CGI-Skripte?
Auf jeden fall is Python besser als Pascal ( lern letzteres auch gerade gezwungenermasen in der Schule
viel spaß noch
Bislang setzen wir es für diverseste Parser ein. Und da möchte ich nochmal kurz hier darauf hinweisen, dass die BioPython-Bibliotheken scheisse sind. Zumindest der DNA -> Protein-Übersetzer…